瓊脂糖核酸電泳步驟
1. 用蒸餾水將制膠模具和梳子沖洗干凈, 放在制膠平板上, 封閉模具邊緣, 架好梳子;
2. 根據(jù)欲分離 DNA 片段大小用凝膠緩沖液配制適宜濃度的瓊脂糖凝膠:準確 稱量瓊脂糖干粉, 加入到配膠用的三角燒瓶內(nèi), 定量加入電泳緩沖液(一般
20~30 ml);
3. 放入到微波爐內(nèi)加熱熔化。冷卻片刻, 加入一滴熒光染料,輕輕旋轉(zhuǎn)以充分
混勻凝膠溶液,倒入電泳槽中,待其凝固;
4. 室溫下 30~45 分鐘后凝膠全凝結(jié), 小心拔出梳子, 將凝膠安放在電泳槽內(nèi);
5. 向電泳槽中倒入電泳緩沖液,其量以沒過膠面 1mm 為宜,如樣品孔內(nèi)有氣
泡,應設(shè)法除去;
6. 在 DNA 樣品中加入 10×體積的載樣緩沖液(loading buffer),混勻后,用槍
將樣品混合液緩慢加入被浸沒的凝膠加樣孔內(nèi);
7. 接通電源, 紅色為正極,黑色為負極, 切記 DNA 樣品由負極往正極泳動 (靠
近加樣孔的一端為負)。一般 60 ~ 100V 電壓,電泳 20 ~ 40min 即可;
8. 根據(jù)指示劑泳動的位置,判斷是否終止電泳;
9. 電泳完畢, 關(guān)上電源, 在凝膠成像儀上觀察電泳帶及其位置,并與核酸分子
量標準 Marker 比較被擴增產(chǎn)物的大小。
瓊脂糖凝膠濃度與線形 DNA 的最佳分辨范圍 | |
瓊脂糖凝膠濃度 | 線形 DNA 的最佳分辨范圍(bp) |
0.5% | 1,000 ~ 30,000 |
0.7% | 800 ~ 12,000 |
1.0% | 500 ~ 10,000 |
1.2% | 400 ~ 7,000 |
1.5% | 200 ~ 3,000 |
2.0% | 50 ~ 2,000 |
膠回收純化 DNA
1. 瓊脂糖電泳,將特異電泳帶用刀切下放入到 EP 管中,稱瓊脂糖帶的重量;
2. 按照每 100mg 加 400µl 的量加入binding buffer,放入到 EP 管振蕩器中,45℃ ~
55℃溫育振蕩,直到所有的瓊脂糖都溶解(大概要 5 分鐘 );
3. 取出純化柱, 將上述溶解液轉(zhuǎn)移至柱中, 室溫下放置 2 分鐘, 8,000rpm 離心
1 分鐘,棄 EP 管中的液體,將純化柱放回 EP 管中;
4. 加 500µl 的 wash buffer 至柱中, 8,000rpm 離心 1 分鐘。棄管中的溶液;
5. 重復操作 4 步的操作 1 次,最后將純化柱放入 EP 管中 10,000rpm 離心 30 秒,
除去痕量的 wash buffer;
6. 將純化柱放入一個新的 EP 管。加 30~40µl H2O 或者 elution buffer 至純化柱膜 的中央,在37℃或 50℃下放置 2 分鐘, 10,000rpm 離心 1 分鐘洗脫 DNA,將
EP 管中的 DNA 溶液放在-20℃保存。
7. 注: 若想要不電泳而直接純化 DNA 溶液, 只需要在第 2 步中按 100µl 液量加 400µl 的 binding buffer,其余的步驟不變。